導論: 魚缸含氮廢物的處理很重要，如何將水有效的降低氨氮和亞硝酸鹽將是養殖成敗的關鍵。所以需要硝化細菌的過濾裝置，才能將水中有毒的氨氮和亞硝酸鹽有效的降至安全範圍。
一、硝化細菌繁殖所需
1、高氧量
硝化細菌的硝化、亞硝化作用需要大量的氧氣；提高水中的溶氧量，不僅可以讓魚兒活的更健康，更可以為硝化細菌提供充足的能量，來分解水中的毒素。同時我們知道，一旦水體處於缺氧狀態，硝酸鹽就會被還原菌還原成有毒的亞硝酸鹽和氨，還會產生另一種有毒物質——硫化氫，後果相當可怕。
2、附著物
硝化細菌的生長繁殖需要附著物。和魚塘相比，水族箱的好處是可以配備一套強大的過濾系統，這是培養硝化細菌的好地方。所以在水族箱中我們經常用生化棉、生化球、陶瓷環等附著性好、多孔的材料，盡量增大濾水面積，讓更多的硝化菌生活。
3、繁殖慢
硝化菌繁殖是極慢的，大約需要10－20多小時才能繁殖一代。而把有機物分解為氨的異養細菌幾分鐘幾十分鐘就可以繁殖一代，其亞硝化、硝化作用遠遠跟不上氨化反應的速度，造成氨濃度的急劇升高，氨中毒、以及氨化過程中消耗大量氧氣導致的缺氧，最容易導致魚類死亡。
4、人工添加
我們要讓硝化細菌大量繁殖直到它們能夠及時分解處理水中不斷產生的氨和亞硝酸，這個過程就是我們常說的『養水』，在自然繁殖的情況下，這個過程大概需要4－6週。所以，如果我們希望快速建立硝化系統，在開缸時人工添加一定劑量的硝化細菌是必要的。
二、消化菌製劑形式
1、 液態(活菌)
液態菌都是密閉包裝，在這種低氧甚至無氧條件下，硝化細菌只能存活很短的時間，很快就會死亡。液態菌的優點是活菌，入水後可很快發揮功效，短期內明顯改善水質；缺點是無法長時間保存。
2、 乾粉(休眠菌)
在乾燥條件下硝化細菌會進入休眠，存活期可長達2年。這種干粉易於保存和運輸，是近年來比較流行的硝化細菌製劑，缺點是因為處於休眠狀態，入水後硝化細菌不會立即工作，而是要經過活化，3－5天才能開始生長繁殖，逐漸發揮作用，所以對於水質急劇惡化，需要立即改善的水體是不適用的。
三、硝化細菌與光合細菌製劑有什麼不同
1、細菌顏色
無論那一種光合細菌，通常都因為含有光合色素，如細菌葉綠素（綠色）、類胡蘿蔔素（橙黃色）等，而呈現一定顏色。硝化細菌則因不含任何光合色素，不會有呈色現象，因此可利用此種特徵做初步的判斷。
2、菌液味道
光合細菌它的商品一旦開封之後，可以立即聞到一股惡臭，硝化細菌應該是沒有明顯的臭味的。
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